怀孕初期同房后有褐色分泌物可能是由于先兆流产或宫颈病变等原因导致的，不同的病因要选择不同的治疗方式。

1.先兆流产：是指患者怀孕初期同房力度过大，从而刺激到子宫和宫颈等部位，从而导致先兆流产，会出现阴道出血或有褐色分泌物等症状，患者应及时到医院进行检查彩超和孕酮等，观察胚胎的情况。

2.宫颈病变：是指患者宫颈部位出现炎症，导致同房后出现接触性出血，会出现疼痛或褐色分泌物等症状，可以服用左氧氟沙星、头孢地尼或头孢克肟等药物进行治疗，请在医生的指导下用药。

建议患者怀孕初期应该避免同房，要保持外阴清洁和干燥，要勤换内裤，避免发生感染，孕期要补充含蛋白质和维生素高的食物，从而补充体内的营养。怀孕初期同房后有褐色分泌物应该及时到医院进行检查，避免耽误病情。